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图为油菜液相育种芯片。(受访者供图)
“一堆种子摆在面前,哪种长出来的植株更高?哪种产量高?哪种不容易生病虫害?这些信息在育种芯片里都能找到答案。”论文通讯作者、西南大学农学与生物科技学院教授卢坤介绍,育种芯片是生物物种基因检测的重要工具,在畜禽和农作物遗传改良与育种研究中发挥着重要作用。研究人员通过育种芯片可了解这类种子的大部分特性,从而指导品种培育工作。目前育种芯片在小麦和玉米等农作物中应用较为广泛,但在油菜上的相关研究和应用则较少,且主要依靠固相育种芯片来提供检测数据。
2014年起,卢坤带领的研究团队选取了588份有代表性的油菜品种进行全基因组重测序,并从挖掘的500多万个变异位点中筛选出5万多个位点,设计了首款液相育种芯片。验证显示,液相育种芯片能够针对同一个位点进行多次检测,准确性相比传统的固相芯片更高,成本则仅为后者的十分之一到五分之一,能够更好地为油菜靶向捕获测序、遗传分析和基因组育种提供基因组学资源。
图为卢坤在油菜试验田里进行取样作业。新华社记者王全超 摄
“这项研究成果对开展油菜基因组设计育种、提高我国油菜生物育种水平具有重要意义。”中国遗传学会植物与基因组专业委员会委员李加纳认为,液相芯片的使用为开展基因组设计育种工作打下基础,还可以利用育种芯片对品种进行监测,有助于提高育种效率,设计培育高产、优质的油菜新品种。
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